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暗号数理情報学研究室 （数理情報第1研究室）
高木　剛 教授	高安 敦 講師

離散情報学研究室 （数理情報第2研究室）
定兼　邦彦 教授	平井　広志 准教授
河瀬　康志 特任准教授

数値情報学研究室 （数理情報第3研究室）
松尾　宇泰 教授	中島　研吾 教授
田中　健一郎 准教授

統計情報学研究室 (数理情報第4研究室)
駒木　文保 教授	松田 孟留 准教授
長尾　大道 准教授

計画数理情報学研究室 （数理情報第5研究室）
武田　朗子 教授	佐藤 一宏 講師

学習数理情報学研究室 （数理情報第6研究室）
山西 健司 教授	鈴木　大慈 准教授
久野　遼平 講師

計算情報学研究室 （数理情報第7研究室）
岩田　覚 教授	谷川　眞一 准教授
五十嵐 歩美 准教授

非線形物理学研究室 (数理情報第8研究室，新領域創成科学研究科)
郡 宏 教授	泉田 勇輝 講師

数理データ科学研究室 （数理・情報教育研究センター）
寒野　善博 教授	清　智也 教授
荻原　哲平 准教授

数理生命情報学研究室 (生産技術研究所・工学系研究科・IRCN)
河野　崇 教授	小林　徹也 准教授
田中　剛平 特任准教授	藤原 寛太郎 特任准教授

社会数理情報学研究室 （先端科学技術研究センター）
田中（石井）久美子 教授

脳数理情報学連携研究室 (理化学研究所)
Andrea Benucci 教授	豊泉 太郎 教授